Zgodnie z zaleceniami Komisji Europejskiej, do ustawy wprowadzono zapis, który nakazuje marszałkom województw prowadzenie rejestru wstępnie uznanych grup producentów, uznanych organizacji producentów i ich zrzeszeń oraz ponadnarodowych organizacji producentów i ich zrzeszeń. Obecne przepisy nie przewidują obowiązku prowadzenia takich rejestrów przez marszałków województw.
Wstępnie uznana grupa producentów to podmiot, w skład którego wchodzi co najmniej 5 osób, posiada ona osobowość prawną (wpis do Krajowego Rejestru Przedsiębiorców). By grupa producentów mogła starać się o zarejestrowanie jako grupa wstępnie uznana, musi w roku poprzedzającym złożenie wniosku wyprodukować i sprzedać produkty wartości co najmniej 50 tys. euro.
Projekt nowelizacji ustawy przewiduje także poszerzenie kompetencji dyrektorów oddziałów regionalnych Agencji Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa. Dyrektor, w ramach weryfikacji wniosków o przyznanie pomocy finansowej uznanym organizacjom producentów, będzie przeprowadzał kontrolę w tych organizacjach.
Dyrektor oddziału ARiMR będzie także monitorował i oceniał sposób wdrażania krajowej strategii programów operacyjnych.
Do ustawy rząd zaproponował dołączenie przepisów dotyczących programu "Owoce w szkole". Natomiast wykreślone zostały regulacje, które odnoszą się do uchylonych przepisów unijnych dotyczących rynku tytoniu. Oznacza to, że z ustawy zostanie usunięty podział krajowej płatności uzupełniającej na część: związaną i niezwiązaną z produkcją surowca tytoniowego. W ustawie pozostaną jedynie przepisy dotyczące płatności niezwiązanej z produkcją tego surowca.
Nowelizacja przewiduje wprowadzenie nowego rozdziału: "Rynki lnu i konopi uprawianych na włókno". Obecne przepisy dotyczące wspólnej organizacji tych rynków zawarte są w innej ustawie (o organizacji niektórych rynków rolnych). Do noweli przeniesiono także przepisy dotyczące rynku zbóż, aktualnie zawarte w ustawie o Agencji Rynku Rolnego i organizacji niektórych rynków rolnych.
Nowe rozwiązania mają obowiązywać po 14 dniach od daty ogłoszenia.